L’évolution de la coopération territoriale européenne se décline dans des instruments nouveaux. Ces changements traduisent un constat d’échec : la dispersion des fonds structurels et les programmes sectoriels a réduit l’impact des politiques communautaires sur le développement territorial. C’est dans ce cadre qu’à partir de 2009 apparaissent deux types de coopération territoriale renforcée : les macro-régions et les stratégies maritimes. A partir de l’évolution de la stratégie macro-régionale de la Mer Baltique ainsi que du parcours de la stratégie maritime Atlantique, cet article vise à énumérer les processus et les facteurs qui déterminent la mise en oeuvre de ces initiatives, afin de définir la relation entre elles.