Cet article explore la manière dont les débuts de la Réforme protestante ont affecté les stratégies commerciales et économiques des compagnies marchandes d’Allemagne du Sud, et avant tout celles qui rendaient des services commerciaux et financiers à l’Église catholique. Mise à part la compagnie des Fugger, dont les activités ont été étudiées en détail par Aloys Schulte et Götz von Pölnitz, cette approche s’applique particulièrement à la Compagnie des Welser d’Augsbourg, qui commerçait sur une base régulière avec la Curie et des membres du clergé. Fondé sur l’exploitation de sources nouvellement mises au jour, cet article déploie une perspective comparatiste pour analyser les changements des pratiques commerciales et financières des deux grandes compagnies d’Allemagne du Sud à l’ère de la Réforme, dans leurs relations avec l’Église.