L'histoire générale de l'Inquisition portugaise attend encore d'être écrite. Le présent article sonde les raisons de cette étonnante absence, par comparaison avec les cas italien et espagnol. Une vaste sélection de travaux est discutée ici dans le but de dégager une perspective et de permettre une première synthèse critique sur l'Inquisition portugaise. Après un bref examen de l'historiographie classique jusqu'à la Révolution des Œillets (1974), on soulignera les remarquables progrès réalisés par l'historiographie moderne dans trois directions de recherche sur un tribunal qui a marqué profondément la vie religieuse portugaise à l'époque moderne : les relations de l'Inquisition avec l'Etat et la société ; la colaboration entre les inquisiteurs et d'autres membres du clergé, ainsi que les formes de résistance à l'intérieur de l'Église ; l'action aux multiples facettes de l'Inquisition dans l'empire colonial.