Charles Robin fut l’opposant principal à la théorie cellulaire en France au cours de la période 1850-1880. Il s’agira ici de comprendre cette opposition à l’aune du vaste système anatomophysiologique élaboré par Robin durant la seconde moitié des années 1840. Ce système était fondé sur une conception chimique et dynamique de la substance vivante, et ne laissait aucune place significative au niveau cellulaire. Nous montrons également que le schéma explicatif de Robin était lui-même solidaire d’une attitude philosophique marquée par le positivisme comtien. Comme Auguste Comte, Robin ne se départit jamais d’une certaine hostilité vis-à-vis de ce qui était perçu en France comme une actualisation directe des principes de la Naturphilosophie allemande. La dernière partie de cette étude expose la controverse qui opposa Robin à Rudolf Virchow entre 1866 et 1873. Cela nous permettra de relativiser l’héritage de Robin, et donc son influence réelle sur le cours de la biologie française.