L’enseignement des sciences est souvent présenté comme une école de la raison et de l’esprit critique. En France, comme dans d’autres pays, c’est aujourd’hui la démarche d’investigation qui est censée permettre une telle formation. Cette contribution vise à questionner ce qui est souvent présenté comme une évidence. En prenant le cas d’un manuel très répandu et des activités qu’il propose pour l’enseignement de la biologie de l’hérédité en classe de troisième française (grade 9), nous montrons que ces « activités » donnent une idée très déformée du régime de vérité des savoirs scientifiques. Nous en proposons une explication tenant à la fois à l’épistémologie dominante des enseignants, à une généralisation inconsidérée de la démarche d’investigation et au choix des problèmes travaillés. Ce qui nous conduit à proposer des conditions de possibilité d’un enseignement permettant aux élèves des investigations scientifiques.